Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptx4Q6RUU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms