Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc154Q6RUT8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc154Q6RUT8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms