Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms