Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfrlQ6PE55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms