Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms