Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms