Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smchd1Q6P5D8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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