Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms