Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms