Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms