Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms