Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms