Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr44Q6NVE8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms