Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utf1Q6J1H4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms