Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms