Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt40Q6IFX3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms