Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt42Q6IFX2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms