Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms