Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms