Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms