Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd7aQ69ZU6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd7aQ69ZU6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms