Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PnkdQ69ZP3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms