Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ric1Q69ZJ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms