Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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