Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms