Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp9bQ66X22 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9bQ66X22 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms