Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpgs2Q66JT5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpgs2Q66JT5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms