Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms