Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VclQ64727 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VclQ64727 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VclQ64727 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms