Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irf4Q64287 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irf4Q64287 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms