Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Lcn3Q62471 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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