Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms