Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms