Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nptx1Q62443 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nptx1Q62443 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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