Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndrg1Q62433 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndrg1Q62433 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms