Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms