Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Supt6hQ62383 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms