Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf6Q62311 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf6Q62311 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf6Q62311 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf6Q62311 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf6Q62311 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Taf6Q62311 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf6Q62311 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf6Q62311 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf6Q62311 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms