Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms