Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SypQ62277 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SypQ62277 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SypQ62277 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms