Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms