Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms