Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3bQ62141 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms