Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrxQ61687 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrxQ61687 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AtrxQ61687 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtrxQ61687 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtrxQ61687 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms