Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms