Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne1Q61457 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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