Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2bQ61313 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2bQ61313 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms