Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AcanQ61282 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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