Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Igbp1Q61249 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Igbp1Q61249 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms