Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef1Q61210 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef1Q61210 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms